Gene Set Enrichment Analysis ist eine der vielen Ansätze zur Analyse der Genexpression Profil Daten und ist in einem Papier von den Arbeitern am Broad Institute beschrieben. Das grundlegende Konzept wurde durch die Beobachtung, dass das Studium einzelner Gene, die die meisten signifikanten Unterschied in der Expression zwischen zwei Staaten oder Phänotypen fehlt aufgefordert [...]
Autorenarchive: Paul Denny
Pathway Analysis unter Verwendung des Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) Werkzeug
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Joys of bearbeiten akademischen Wissenschaft Pfund
Oder:"Ein Leitfaden für Anfänger zur Herding Cats". Betrachten Sie dieses Szenario: Sie sind eine akademische Wissenschaftler, in einem langen Forschungsinstitut und Ihr Chef wird aufgefordert, ein Buch bearbeiten, aber lehnt aufgrund des Drucks der Arbeit; dann legt nahe, dass es aussehen würde in Ihrem Lebenslauf gut. Sie stimmen, es würde auf Ihrem Lebenslauf gut, so [...]
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Wie funktioniert eine Mutation in einem Transkriptionsfaktor Ursache Leim Ohr?
Die akute Otitis media, manchmal als "Klebstoff Ohr" bekannt, ist die häufigste bakterielle Infektion bei Kindern und 1 Lebensjahr über 60% der Kinder haben eine Episode. In einigen Fällen, Kinder entwickeln eine chronische Erkrankung, welche, trotz der Infektion geheilt, die “Kleber” geht nicht weg und verursacht Taubheit. In einer [...]
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Target-Erkennung in der Kindheit beginnende Asthma
Asthma wird durch eine Kombination von Umwelt-und genetische Einflüsse, aber die spezifischen Faktoren werden kaum verstanden. Ein signifikanter "Hit" in einer genomweiten Assoziationsstudien Scans erkannt (GWAS) for childhood asthma led a client to believe that one gene might be partially responsible. Der Beweis, dass diese genetische Assoziation wirklich verursacht wurde Asthma war, jedoch, schwierig. Firstly, [...]
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Pathway-Analyse von Genexpressionsdaten – male reduzierte Fertilität / Sterilität
A group of animals that can breed and produce fertile offspring is one of the definitions of a species. This means that the biological mechanisms of fertility and infertility are of interest not only to evolutionary biologists, but also to clinicians and of course to the wider public. At the Institute of Molecular Genetics in [...]
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Target-Entdeckung in geerbten Muskelschwäche
Muscle weakness can be caused by a rare inherited disease called myofibrillar myopathy. Gonzalo Blanco’s team found a mouse model of this disease and wanted to identify the underlying cause of the severe muscle weakness. Their aim was to discover potential therapeutic targets to translate into pre-clinical and clinical studies. Before I became involved, the disease had [...]
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