Kalamnan kahinaan ay maaaring sanhi ng isang bihirang minana sakit na tinatawag na myofibrillar myopathy. Gonzalo ni Blanco koponan natagpuan ang isang mouse modelo ng sakit na ito at nais na makilala ang kalakip na dahilan ng malubhang kahinaan ng kalamnan. Ang kanilang layunin ay upang matuklasan ang mga potensyal na nakakagaling na mga target upang i-translate sa pre-klinikal at clinical mga pag-aaral.
Bago ako ay naging kasangkot, ang sakit ay nama-map sa isang malaking rehiyon ng isang kromosoma at Dr Blanco ng koponan ay pagpaplano upang gamitin ang maginoo posisyonal pamamaraan sa pag-clone upang mahanap ang pagbago. Ipinanukala ko na ang isang mas mabilis na diskarte ay magiging upang gamitin sa tabi-generation sequencing naka-target sa gene sa rehiyon. Ako dinisenyo ng isang hanay ng mga probes upang magpayaman tiyak fragment DNA at nagtrabaho ako sa isang bioinformatician, Dr. Michelle Simon, upang magdisenyo ng software pipeline upang mahanap at makilala mutations.
Sa katapusan ng proseso ng disenyo, the pipeline was used to identify mutations in the muscle weakness mutants and predict that they altered the coding sequences of two genes; Myh4 at Pmp22. Dalawang linya ng katibayan iminungkahing na ang pagbago sa Myh4, na mga code para sa isang protina kalamnan myosin, ay ang pinaka-malamang na dahilan ng panghihina. Una, ang aming mga kasamahan natagpuan na Mice pagdala lamang ang myosin pagbago pa rin ay nagkaroon ng kaugalian at ikalawa, abnormal protina Pinagsasama-sama mula sa mga apektadong Mice nakapaloob malalaking halaga ng myosin.
Mga siyentipiko sa MRC ni Mammalian Genetics Unit na ginamit ang parehong diskarte, Michelle na Simon at ako Pinangunahan, upang makahanap ng mutations sa iba pang mga modelo ng sakit.
Publication sa Human Molecular Genetics
Ang testimonial mula sa Dr. Gonzalo Blanco