Asma è causata da una combinazione di ambientale e genetico influenze, ma i fattori specifici sono poco conosciuti. Un significativo "hit" rilevato in un genoma-wide association scan (GWAS) for childhood asthma led a client to believe that one gene potrebbe essere parzialmente responsabile. Dimostrare che questa associazione genetica realmente stava causando asma era, tuttavia, difficile. In primo luogo, nessuno sapeva la funzione della proteina prodotta dal gene e secondariamente, cambiando geni nell'uomo per testare un'ipotesi, piuttosto che come terapia, è tecnicamente impegnativo & eticamente discutibile, specialmente nei bambini. Per fortuna, topi condividere circa 90% dei loro geni con gli esseri umani, così gli scienziati "knock-out" il gene equivalente, poi verificato se questi animali si comportavano come bambini con asma. La risposta breve è - non l'hanno fatto. In funzionalità polmonare test che avrebbe dovuto raggiungere asmatici per i loro inalatori, il topi knock-out erano completamente normale. Così, quello che stava succedendo? Erano topi non abbastanza come gli esseri umani? Era questo il gene sbagliato?
Per questo progetto, Sono tornato a primi principi - quello che era il prova sostenere l'idea che questo gene è stato responsabile per il rischio di asma aumento? Scavando attraverso la letteratura on-line, in particolare i documenti di altri gruppi che studiano lo stesso gene e materiale supplementare non disponibile in stampa, ci sono stati suggerimenti che gli effetti genetici sono stati più complessi. Ho trovato la prova che altri due geni nelle vicinanze erano più o meno trascrizionalmente attivo negli asmatici e quindi potrebbero svolgere un ruolo nella suscettibilità all'asma. Inoltre, utilizzando i dati del ENCODE progetto, Ho trovato che l'elemento normativo previsto per controllare questi geni è stato conservato nei topi, quindi sarebbe possibile testare le previsioni sperimentalmente.
Ciò ha suggerito un romanzo bersaglio terapeutico - Alterare l'attività di un cluster di geni, piuttosto che uno solo, potenza modificare il rischio di malattia.
