我々の遺伝子の一部が不足しています…しかしどれ?

一つは、考えることができます 遺伝子 多くの点で:

1. DNAレベルで – 単にヌクレオチドの直鎖状配列として, ONE一定の順序で, で “ノーマル” 状態, または
2. 再度DNA分子として, 生物のそれを覚えている遺伝子, むしろ試験管中のDNAの断片に比べ, 異なる個人の変動の対象となり, または
3. 第三の方法は、比喩的にズームアウトすると、生物全体の観点から遺伝子の変化を生じさせるそれらの遺伝子の変化を考えることです。 表現型.表現型の変化はのものです ダーウィン, 上の原料 自然淘汰 作品.

私が書いた 以前に 約 小さなマウス (専門用語名 – ザ(13)36H) 持っていた 失われた それのいくつかだ 遺伝子 この損失は非常に複雑に関連していたことを 表現型, 私たちの論文に記載されて とにいくつかの点で類似し 人 それはまた、持っていた 失われた のチャンク 遺伝子.

我々は最初にこのマウスを研究したとき, 私たちの一つ 妨げ だった私たちは 知っていた わずか約 少数 の 遺伝子 削除されたこと – 我々は、ゲノムシーケン革命の初期段階にあった, マウスの場合にのみビット (と人間) ゲノムを配列決定し、遺伝子がマップアウトされていた. 我々のことができるようにしたかったので、これは重要だった クロス比較 マウスおよびヒト 表現型 との順序でこれを行うには, 私たちは、かどうかを知るために必要な 遺伝子 で失わ マウス 持っていた 同等 で 人間 およびその逆.

そう, 私たちが直面した課題は、であった 見つける それらの 行方不明 遺伝子. DNA配列決定によって遺伝子を見つけるための最善の方法についての継続的な哲学的および技術的な引数がありました, その2つの陣営に分けることができます – マッパーと即興. マッパーは、最初のマップを取っ, シーケンスその後アプローチと最初のシーケンスに好ま即興, その後シーケンスをチェックする地図.

我々は最初のキャンプに落ちた – そう私たちの最初の仕事は、私たちの小さなマウスで削除地域全体マップを構築することでした. しかし、どのようにマップを構築するか “目に見えない” 風景?

明らかに, 何であるか尋ねることによって プレゼント で ノーマル マウスや ない 私たちの中で 小さなマウス – 両方の親から削除され染色体を継承していたマウスはなかったので、これはより困難になった 生き残れない ずっと注入を超え. 私たちは、1つまたは2つの関連した遺伝子のコピーではなく、二つのコピーまたはなしのシンプルな状況を持っていたマウスを使用してマップを作成する必要がありました. それは質問に答えることはより困難であると驚かれるかもしれ – 我々は持っていない 1 または 2 よりもむしろ 2 または なし? それにもかかわらず, 私たちは、マップを構築し, と私は上記の書いたものにもかかわらず, 我々 シーケンス マップの一部 私たちは一緒に行ってきましたように, 我々は決定風景の完全な輪郭を持っていたまで待つのではなく、. そう, 私たちは、風景の一部をマッピングされ、かつて我々は、その部分の自信を持っていた, シーケンシングのためにそれをオフに送信する. DNA配列が返され次第、, ザ 遺伝子 あっ順番に埋め 発見 ゆっくりと, A 遺伝子マップを完了 だった 一緒にステッチ. 我々は日常的に自動化された遺伝子をフォロー “注釈” 手動検査とエラーチェックで, 私たちは、ゴールド·スタンダード遺伝子マップを供給信じている.

だから私たちは何を見つけた?

よく, それが判明している 236 遺伝子 あった 削除された 私たちの小さなマウスで, プラスも 95 “偽” – 不確かな機能を持つ遺伝子 – どちらか彼らは生きているマウスに重要ではありませんが、おそらく進化の選択やそれらの材料として振る舞う 他の遺伝子を調節することが? 遺伝子の私たちができること 認める, 最も顕著なものの一つは、いくつかがあったということでした 遺伝子のクラスター これは、互いに類似度の高いレベルを示した – 彼らはに属し 遺伝子ファミリー. 我々は彼らの人間同等にこれらの遺伝子ファミリーを比較する, 主な驚きだった サイズ の 家族 かもしれません 非常に異なる. 3つの遺伝子の一つの家族は上​​の他の遺伝子の切り替えに関与するタンパク質をコードし、オフ (遺伝子調節) だった ほとんど 同じ で マウス と 人間 – 一方、もう一つの家族, 作成 タンパク質 その 相互に作用する ととも​​に フェロモン 配偶者選択に関わる, だった ヒトよりマウスで数の5倍. 確かに, ヒトフェロモン相互作用遺伝子は、非機能が登場; 彼らはいた “偽”. 我々は、マウスとヒトの間に交尾行動の違いを考えるとおそらく、我々はそうこれで驚いてはいけません…

登場全体のテーマはある 分極 – 削除された領域が含まれています 遺伝子 ということです ヒトに非常によく似 遺伝子と 他人 その可能性 しない 機能がある 人間の同等. しかし、本当に私たちの小さなマウスで削除された遺伝子のリストの意味を理解し、それは人間の表現型や病態への関連性のために, 我々はする必要が 理解する 実際にどのようなこれらの遺伝子を行う?

そして、それは別の日の話です. Tweet to @pauldennyuk